豊橋市自然史博物館では、自然史に関するさまざまな資料を収集し、収蔵庫で保管しています。その中には、生物の名前をつける際に基準となる標本として指定された標本、「タイプ標本」も含まれています。
豊橋市自然史博物館資料収集方針
| 収蔵資料状況（2021年3月31日現在） |
| 古生物 67,874点 |
魚類 3,934点 |
| 岩石・鉱物 8,970点 |
両生類 126点 |
| 植物 34,337点 |
爬虫類 215点 |
| 貝類 185,441点 |
鳥類 941点 |
| 甲殻類 1,936点 |
哺乳類 812点 |
| 昆虫 249,344点 |
その他 6点 |
| その他無脊椎動物 821点 |
合計 554,757点 |
